1º Passo: É necessário criar uma conta manualmente do tipo crediário com o valor do adiantamento e plano de contas  "Contas a Receber" (caso for um crédito - cliente) ou "Contas a pagar" (caso for um débito - fornecedor);
2º Depois disso basta  realizar a baixa com a forma de pagamento que foi recebida ou paga no adiantamento e replicar o valor da conta no campo de desconto, e marcando o flag "Troco Crédito em Aberto";
Após confirmar o pagamento, o sistema vai registrar 3 lançamentos na tela referente a esse adiantamento. Um referente a entrada do adiantamento no caixa e outros 2 que vão se abater no momento que o cliente usar o credito dele, antes disso a empresa vai ficar com um lançamento baixado do tipo débito para representar que o cliente tem um um saldo com a empresa.
Segue em o vídeo a baixo, para melhor compreensão.